Да, ретаргетинг настраивается через пиксель рекламной системы напрямую и не зависит от Google Analytics - в России для этого чаще используют Яндекс Метрику и данные рекламных кабинетов.
Остались вопросы по вашему проекту? Обсудим детали и предложим стратегию.